使おうとしているPHP関数のライブラリが有効になっていません。
~/php-files/php4/php.ini (PHP4) ~/php-files/php5/php.ini (PHP5)
にあるphp.iniに
extension=○○○.so (○○○はライブラリ名)
と記述してライブラリを有効にしてください。
常駐プロセスの利用自体は特に構いません。
ただしリソース制限(CPU消費時間)がありますので、CPU時間を使いきってしまうと強制終了しますのでご了承ください。
setenv LOCAL_DIR $HOME/local setenv PORTS_DIR $HOME/ports setenv WRKDIR $PORTS_DIR/work setenv PREFIX $LOCAL_DIR setenv PKG_DBDIR $PORTS_DIR/pkg setenv PORT_DBDIR $PORTS_DIR/db setenv INSTALL_AS_USER 自分のアカウント名
上記の環境変数を設定して、ホーム以下に local ディレクトリと ports/db、ports/distfiles 、ports/pkg、 ports/work などを作ってあげてください。
そうすれば /usr/ports 以下に移動してmakeすれば多くのものはインストールできると思います。
申し訳ございませんがJava(tomcat)はご利用頂けません。